Pemerintah Kabupaten Kepulauan Yapen, melalui Dinas Kesehatan terus meningkatkan mutu pelayanan Kesehatan bagi Masyarakat. Pelayanan kesehatan antara lain :
Rumah Sakit Umum
Rumah Sakit Umum Daerah Serui (RSUD-Serui) merupakan Rumah Sakit satu-satunya yang ada di daerah Kepulauan Yapen (alamat : Jl. Wainakawini Serui)
Pusat Kesehatan Masyarakat (Puskesmas) ; 15 Unit
- Puskesmas Serui Kota
- Puskesmas Warari
- Puskesmas Kosiwo
- Puskesmas Dawai
- Puskesmas Ansus
- Puskesmas Poom
- Puskesmas Yobi
- Puskesmas Tindaret
- Puskesmas Menawi
- Puskesmas Reradumpi (Ambai)
- Puskesmas Mumbeai (Randawaya/Ampimoi)
- Puskesmas Waindu
- Puskesmas Wooi
- Puskesmas Windesi
- Puskesmas Yawakukat
Puskesmas di Kepulauan Yapen dikategorikan Puskesmas Perawatan dan Non Perawatan
- 4 Puskesmas Perawatan, yaitu Puskesmas Dawai, Puskesmas Menawi, Puskesmas Ansus dan Puskesmas Poom
- 11 Puskesmas Non Perawatan
Puskesmas Pembantu (Pustu) ; 78 Unit
- Pustu Mariadei
- Pustu Banawa
- Pustu Serui Laut
- Pustu Pasir Hitam
- Pustu Turu
- Pustu Anotaurei
- Pustu Yapan
- Pustu Kando
- Pustu Famboaman
- Pustu Mantembu
- Pustu Sarawandori
- Pustu Aromarea
- Pustu Tatui
- Pustu Pandoami
- Pustu Kamanap
- Pustu Mariarotu
- Pustu Kanawa
- Pustu Ambaidiru
- Pustu Mambo
- Pustu Borai
- Pustu Woniwon
- Pustu Kontiunai
- Pustu Yapanani
- Pustu Wadapi
- Pustu Wanampimpi
- Pustu Saweru
- Pustu Diwipi
- Pustu Wamori
- Pustu Dorau
- Pustu Wabombi
- Pustu Korombobi
- Pustu Wabo
- Pustu Kurudu
- Pustu Kaipuri
- Pustu Duai
- Pustu Warironi
- Pustu Waita
- Pustu Ampimoi
- Pustu Karoepi
- Pustu Bareraipi
- Pustu Wabuayar
- Pustu Mamarin
- Pustu Barawai
- Pustu Sawendui
- Pustu Aisau
- Pustu Woda
- Pustu Sawendui
- Pustu Roswari
- Pustu Kiryow
- Pustu Sambrawai
- Pustu Yobi
- Pustu Soromasen
- Pustu Warabori
- Pustu Papuma
- Pustu Kairawi
- Pustu Sasawa
- Pustu Natabui
- Pustu Webi
- Pustu Yenusi
- Pustu Miosnom
- Pustu Woinap
- Pustu Kanaki
- Pustu Aibondeni
- Pustu Ausem
- Pustu Serewen
- Pustu Rarisi
- Pustu Woriol
- Pustu Makiroan
- Pustu Numbeawai
- Pustu Nurawi
- Pustu Waisani
- Pustu Munggui
- Pustu Asai
- Pustu Kaonda
- Pustu Karawi
- Pustu Rosori
- Pustu Sarderi
- Pustu Oryobu
Pada tahun 2022 ini, ada sejumlah 2 Pustu yang ditingkatkan menjadi PUSKESMAS, diantaranya Pustu Miosnum ditingkatkan menjadi Puskesmas Yerui dan Pustu Kurudu Kaipuri ditingkatkan menjadi Puskesmas Pulau Kurudu.
Pos Pelayanan Terpadu (Posyandu) ; 177
- Posyandu : 2 Posyandu Pratama
- Posuandu : 175 Posyandu Madya
Penunjang Kesehatan lainnya tersedianya Apotek yang berjumlah 19.